Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hmga1P17095 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hmga1P17095 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms