Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms