Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkceP16054 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkceP16054 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms