Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rag1P15919 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms