Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scd2P13011 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scd2P13011 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scd2P13011 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms