Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl1P12850 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cxcl1P12850 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cxcl1P12850 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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