Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nr4a1P12813 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nr4a1P12813 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms