Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtcP11725 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OtcP11725 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
OtcP11725 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
OtcP11725 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OtcP11725 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OtcP11725 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms