Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl3P10855 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms