Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P10404 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P10404 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P10404 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P10404 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P10404 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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P10404 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P10404 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P10404 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P10404 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P10404 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P10404 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P10404 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P10404 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P10404 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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P10404 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
P10404 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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P10404 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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P10404 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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