Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Amd1P0DMN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms