Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jmjd7P0C872 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms