Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb2P0C1T1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms