Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf3P09920 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf3P09920 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3P09920 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3P09920 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3P09920 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3P09920 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3P09920 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3P09920 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3P09920 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3P09920 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3P09920 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3P09920 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms