Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxc9P09633 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms