Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa6P09092 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa6P09092 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms