Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxb7P09024 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb7P09024 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb7P09024 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms