Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-Eb1P04230 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms