Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tk1P04184 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tk1P04184 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms