Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mtnd1P03888 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms