Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01808 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01808 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01808 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01808 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01808 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01808 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01808 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms