Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01798 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01798 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01798 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01798 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01798 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01798 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01798 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01798 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01798 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01798 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01798 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms