Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01795 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01795 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01795 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01795 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01795 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01795 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01795 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01795 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01795 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01795 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01795 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms