Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01735 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01735 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01735 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01735 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01735 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01735 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01735 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01735 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01735 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01735 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms