Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01635 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01635 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01635 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01635 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01635 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01635 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01635 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01635 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01635 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01635 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01635 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01635 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01635 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms