Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igk-V19-17P01633 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms