Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl20O89093 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccl20O89093 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms