Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh3pxd2aO89032 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3pxd2aO89032 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms