Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MscO88940 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MscO88940 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MscO88940 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MscO88940 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MscO88940 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MscO88940 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MscO88940 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MscO88940 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms