Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apaf1O88879 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apaf1O88879 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms