Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ShdO88834 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ShdO88834 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ShdO88834 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ShdO88834 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ShdO88834 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ShdO88834 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms