Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brd7O88665 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brd7O88665 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms