Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lmx1bO88609 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Lmx1bO88609 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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