Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cops6O88545 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cops6O88545 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cops6O88545 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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