Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dll3O88516 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dll3O88516 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dll3O88516 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms