Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CntfrO88507 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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