Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AurkcO88445 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms