Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChadO55226 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChadO55226 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChadO55226 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChadO55226 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChadO55226 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChadO55226 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChadO55226 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChadO55226 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChadO55226 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms