Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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