Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms