Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copb2O55029 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms