Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SlkO54988 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SlkO54988 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SlkO54988 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SlkO54988 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms