Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dkk1O54908 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dkk1O54908 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms