Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rgs9O54828 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rgs9O54828 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms