Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DffbO54788 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DffbO54788 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DffbO54788 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DffbO54788 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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