Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DffaO54786 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DffaO54786 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DffaO54786 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms