Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms