Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Tnfrsf18O35714 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Tnfrsf18O35714 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfrsf18O35714 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms