Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NudcO35685 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NudcO35685 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NudcO35685 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NudcO35685 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NudcO35685 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NudcO35685 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NudcO35685 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NudcO35685 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms