Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn6O35646 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn6O35646 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn6O35646 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms